Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms