Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2orf42Q9NWW7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf42Q9NWW7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms