Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR3EQ9NVU0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms