Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXD2Q9NVH0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXD2Q9NVH0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXD2Q9NVH0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXD2Q9NVH0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXD2Q9NVH0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXD2Q9NVH0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXD2Q9NVH0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXD2Q9NVH0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms