Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FBXO28Q9NVF7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO28Q9NVF7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms