Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms