Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDFIP2Q9NV92 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDFIP2Q9NV92 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms