Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms