Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms