Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT82Q9NSB4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT82Q9NSB4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms