Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms