Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS45Q9NRW7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms