Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms