Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms