Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BIN3Q9NQY0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BIN3Q9NQY0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BIN3Q9NQY0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BIN3Q9NQY0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BIN3Q9NQY0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms