Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPNPEP3Q9NQH7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms