Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC24A3Q9HC58 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms