Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBV1

POPDC3, Popeye domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC3Q9HBV1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POPDC3Q9HBV1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POPDC3Q9HBV1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms