Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms