Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC28A3Q9HAS3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms