Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms