Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCAD1Q9H4L7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms