Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms