Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH19Q9H159 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms