Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms