Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NBPF3Q9H094 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms