Protein–RNA interactions for Protein: Q9H074

PAIP1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAIP1Q9H074 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAIP1Q9H074 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms