Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRTNQ9H040 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRTNQ9H040 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRTNQ9H040 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPRTNQ9H040 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms