Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NACA2Q9H009 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.3 ms