Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN2Q9H000 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms