Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCIN1Q9C0H9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRCIN1Q9C0H9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRCIN1Q9C0H9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRCIN1Q9C0H9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRCIN1Q9C0H9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRCIN1Q9C0H9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SRCIN1Q9C0H9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCIN1Q9C0H9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCIN1Q9C0H9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCIN1Q9C0H9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCIN1Q9C0H9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCIN1Q9C0H9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCIN1Q9C0H9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRCIN1Q9C0H9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRCIN1Q9C0H9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRCIN1Q9C0H9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms