Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms