Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AMBRA1Q9C0C7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMBRA1Q9C0C7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms