Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNTNAP4Q9C0A0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms