Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM6Q9C030 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms