Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM9Q9C026 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms