Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD2Q9BZL6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms