Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC2Q9BYS8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC2Q9BYS8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms