Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAIPQ9BWF2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms