Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT27Q9BW83 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms