Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP58Q9BVL2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 715.9 ms