Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS2Q9BVG9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2Q9BVG9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms