Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms