Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP9

Putative uncharacterized protein MGC13053, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9BRP9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q9BRP9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q9BRP9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q9BRP9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q9BRP9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q9BRP9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q9BRP9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q9BRP9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q9BRP9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q9BRP9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9BRP9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9BRP9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9BRP9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9BRP9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9BRP9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9BRP9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9BRP9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9BRP9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9BRP9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9BRP9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9BRP9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9BRP9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9BRP9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9BRP9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms