Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22CQ9BRL7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms