Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZSWIM1Q9BR11 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZSWIM1Q9BR11 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms