Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms