Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEIS3Q99687 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms