Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGRRF1Q99675 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms