Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGREF1Q99674 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 724.4 ms